Monad Shoal betragtes som det bedste dykkersted i verden, hvis man vil se de sjældne og sky rævehajer (thesher shark). Disse hajer lever normalt i dybet, men kommer regelmæssigt hertil tidligt om morgenen for at blive renset.
Efter at treforkhajerne af ukendte årsager forsvandt fra Monad Shoal og flyttede til Kimud Shoal, er dette nu et af de bedste dykkersteder i verden til at se de sjældne og flygtige treforkhajer. Disse hajer lever normalt i dybet, men kommer jævnligt her for at se rengøringsstationerne på lavere dybde.
Pasil Reef er et dejligt sandområde, der er velegnet til muck-dykning. Det er også et godt sted til natdykning. Den maksimale dybde er omkring 16 meter. Den gennemsnitlige dybde er 5-8 meter.
Flot koral- og søgræsrev og et godt sted til natdykning. Dette sted er for begyndere og et godt træningssted for åbent vand-elever og avancerede.
Dette er et avanceret dykkersted, der går ned til 28 meter. Dette vægdyk har en gennemsnitsdybde på 12 til 14 meter. Det er et godt dyk for muckdykkere og makrofotografer.
Den lavvandede del af den berømte Lapus-lapus-ø ud for kysten på spidsen af den nordlige del af øen Malapascua. Den har den laveste dybde på 4-5 m og kravler ned til den dybere side på 18-20 m. Det er perfekt for begyndere og avancerede dykkere, der vil observere samspillet mellem havlivet og revet.
Dakit Dakit Pinnacle er ca. 5 meter dybt på toppen og rejser sig derefter til 12-14 meter og har en diameter på 20 meter. Dækket af flotte hårde og bløde koraller, herunder bordkoraller, og store sten med flot vækst.
10-15 minutter fra havnen i Malapascua på bagsiden af øen i den nordøstlige side, med sin flade sandede, græsklædte bund er den perfekt til åbentvandsdykkere, der øver deres opdrift, og ekspertdykkere, der leder efter ekstremt små makrodyr.
En dejlig sandbund og bløde koralrev med sunde kolonier af revfisk med en dybde fra kysten og ud på 10-13 meter, der er perfekt til åbent vand-sessioner og Try Scuba / Try Mermaiding / Try Freediving-sessioner med minimal bådtrafik til at forstyrre træningssessionerne.
Et favorit natdykkersted i Malapascua, der findes på den nordlige del af øen. Dykket starter normalt i skumringen, så dykkerne kan se mandarinfiskene.
3-5m fladt toprev og sandpletter med et skrånende rev ned til 16-17m et perfekt dykkersted til kurser enten til åbent vand, avanceret åbent vand eller højere.
10 minutter fra Malapascua havn til nordsiden, et dybt klippefremspring, der er perfekt til ekspertdykning på udkig efter mellem til stærk strøm ved tidevandsskift, går ned til toppen af fremspringet på 14 m ned til den dybeste del på 34 m.
Lapus II ligger lige ved siden af LapusLapus og starter med et skrånende rev på 12 m, som bliver til en lille væg. Bunden her ligger på omkring 20 meters dybde, og sandbunden med mange sorte koraller og søfanger skråner ned til en maksimal dybde på 30 meter.
Lapus Shallow Dive Site er et ideelt dykkertræningssted. Det er en sandskråning med nogle klippeformationer. Det meste af tiden er der en let strøm, undtagen ved lavvande.
Gato Island er et velbevaret havreservat og fristed for søslanger. Det er et af de fem berømte dykkersteder på øen. Stedet er en tunnel, hvor man tager en tur under øen. Dette sted er bedst for mere erfarne dykkere.