Kar se tiče potapljanja, je Puerto Aventuras nekoliko izven uhojenih poti Playa del Carmen, Cozumel, Akumal in Tulum. Posledično so potapljaški operaterji v Puerto Aventurasu veliko manjši in bolj navajeni, da na izlete peljejo manjše skupine potapljačev. Ti izleti običajno potekajo na dele mezoameriškega sistema koralnih grebenov, ki poteka vzdolž obale polotoka Jukatan in je drugi največji sistem koralnih grebenov na svetu. Do teh delov grebenskega sistema je mogoče priti v le 5–10 minutah z ladjo in so sestavljeni iz raznolikih pokrajin, kot so globoki kanjoni, razpoke in predori. Blag tok tik ob obali Puerto Aventurasa je primeren za potapljače začetnike, čeprav so območja z močnejšim tokom enostavno dostopna tudi z ladjo. Potapljaške trgovine in letovišča na tem območju ponujajo tudi tečaje za pridobitev certifikata za tiste, ki se želijo med počitnicami naučiti dihati pod vodo.
Puerto Aventuras ponuja možnosti potapljanja tako za začetnike kot za izkušene potapljače. Začetniki naj se držijo plitvih potapljaških lokacij na grebenu, ki se nahajajo v delu notranjega in srednjega grebena, izkušeni potapljači pa lahko najdejo večjo globino in potapljanje ob steni v delu zunanjega grebena. Potop na razbitino Mama Viña je prav tako vznemirljiv kraj za napredne potapljače.
Puerto Aventuras je dom številnih morskih vrst, od makroživk, ki živijo na grebenih, do pelagične megafavne. Na mezoameriškem koralnem grebenu so pogosti jastogi, raki, kirnje, angelske ribe, raže, jegulje, morski naredniki in različne druge pisane tropske ribe. Ob robu grebena rade lebdijo številne različne vrste morskih želv, kot so glavate karete, zelene želve in jastrebove želve, pa tudi morske želve morskega orla.
Playa del Carmen je znana kot končna destinacija letne migracije morskih psov, zato občasna opažanja morskih psov dlje od obale Puerto Aventuras niso redkost.
Opazovanja prostoživečih živali temeljijo na vsebini, ki jo ustvarijo uporabniki
Čeprav ni slabega časa za obisk Puerto Aventuras za potapljaške počitnice, so določeni letni časi boljši od drugih za opazovanje določenih vrst morske favne. Na primer, hladnejše vode v zimskih mesecih (25–28 °C) privabljajo več pelagičnih vrst, kot so morski psi. V toplejših mesecih (od maja do septembra) na obalo prispejo zelene in glavate morske želve, da gnezdijo in odložijo jajca na plažah.
