לעתים קרובות צוללנים מוצאים את עצמם לבד בצלילה, בין אם במקרה ובין אם לא. קורס הצלילה העצמאית של SSI Nautilus מלמד צלילה עצמאית, ללא תלות במערכת הצלילה המסורתית בזוגות. צוללנים עצמאיים חייבים להיות מסוגלים להסתדר לבד ולקחת אחריות על בטיחותם בצלילה.
קורס הצלילה העצמאית, שהוא אחד הקורסים הפופולריים ביותר בקרב צוללים מקצועיים, מתמקד בתכנון צלילות, הכרת מגבלותיו ומניעת תאונות, וכן ביתרונות, בסיכונים ובנהלים שיש לנקוט בצלילה עצמאית. תלמדו גם כיצד להשתמש ולהרכיב כראוי את הציוד הנוסף הדרוש לצלילה עצמאית. קורס זה אידיאלי לצלמים וצלמי וידאו תת-מימיים, כמו גם לצוללים המעוניינים להעמיק את הידע שלהם ולרכוש ביטחון בצלילה.