Deze duiklocatie, gelegen aan de noordwestelijke kant van Ishigaki eiland, heeft een van de hoogste percentages van ontmoetingen met manta's ter wereld. Het kan per boot worden bereikt in 10 tot 15 minuten. De waterdiepte is ongeveer 10-20m en het getij is relatief rustig maar kan soms sterker worden. Een kleine heuvel in het midden van de zee is een reinigingsstation waar de manta's op bezoek komen. De manta's zwemmen rond op een diepte van 5 tot 10 meter, zodat je ze kunt zien door te snorkelen.
Crystal Beach (Yamahara Beach) in Kabira, Ishigaki, is een afgelegen plek met natuurlijke kristalafzettingen uit de rivier van Mt. Omotodake. Het ongerepte water herbergt koraalriffen, tropische vissen en zeeschildpadden. De toegang is via een steile helling met beperkte faciliteiten, dus voorbereiding en voorzichtigheid zijn essentieel.
Yonehara Reef is gevonden op het punt in Kawadaira, in het noordelijke deel van Ishigaki Island. Deze plek is alleen voor boten. De gemiddelde diepte is 5 tot 30 meter. Er is een koraalplank op 5 tot 6 meter diepte die in een zanderig gebied valt in 20 tot 25 meter water met drie wortels, dichtbevolkt met tafel- en wervelkoralen.
Sakieda Maze in het westen van Ishigaki Island, Okinawa, heeft complexe rifformaties met natuurlijke bogen en tunnels die magische lichteffecten creëren. Met dieptes van 3 tot 15 meter en zachte stromingen is het geschikt voor beginners. In de ondiepe gedeelten vind je levendige koraalriffen en diverse vissen zoals clownvissen.
De Underwater Ruins werden ontdekt door een lokale duiker in 1986 en is een populaire duikplek in Yonaguni samen met hamerhaaien. Het is ongeveer 15 minuten van de haven. Een enorme trapvormige muur overspant ongeveer 250m oost-west en 150m noord-zuid om de ruïnes te vormen.
Het meest westelijke eiland van Japan. Het is dichter bij Taiwan dan Ishigaki eiland. Het duurt ongeveer 45 minuten vanaf Ishigaki eiland om met het vliegtuig te bereiken. Het hoogtepunt van dit eiland is de grote kans om hamerhaaien te zien. Dit is het punt waar de rotsen, net als gebouwen, verticaal van de bodem van de zee staan op een diepte van 35 meter.