ออกหากินส่วนใหญ่ในเวลากลางคืน โดยล่าสัตว์จำพวกครัสเตเชียน ไส้เดือน และปลาขนาดเล็กตามแนวปะการังน้ำตื้น ด้วยความอดทน ขนาดเล็ก และนิสัยที่สงบของมัน ฉลามเอปอลเลตจึงมักถูกพบโดยนักดำน้ำตื้นและนักดำน้ำที่สำรวจแนวปะการังน้ำตื้น—โดยเฉพาะในลากูนที่มีทรายและพื้นราบของแนวปะการังตามกระแสน้ำขึ้นลง