Manta krátkoploutvá, která je často k vidění osamoceně nebo v malých skupinách, je nepolapitelnější než někteří její větší příbuzní. Příležitostně projevuje aktivitu na hladině, včetně krátkých skoků, ale je méně známý pro rozsáhlé akce prolamování. Stejně jako mnoho jiných mantů čelí ohrožení ze strany rybolovu a nechtěných úlovků, a proto je důležité povědomí o ochraně tohoto méně známého, ale ekologicky cenného druhu.