Ez egy kis sziget az Iriomote-sziget keleti részén, körülbelül 16 km kerületű. A szigeten egy luxus üdülőszálloda található. E sziget és az Iriomote-sziget között a Yonara vízi útvonal húzódik. A sziget körül körülbelül 400 féle színes korall, például asztali korall és eda korall található, és a trópusi halak nagyon szépek. A Yonara vízi úton több olyan ponton is találkozhatunk manta rájákkal.
Ez az Ishigaki-sziget északnyugati oldalán található merülőhely az egyik legnagyobb arányban találkozik manta rájákkal a világon. Hajóval 10-15 perc alatt elérhető. A vízmélység körülbelül 10-20 méter, és a dagály viszonylag nyugodt, de időnként erősebb is lehet. A tenger közepén egy kis dombon található egy tisztítóállomás, ahová a manta ráják látogatóba jönnek. A manta ráják 5-10 méteres mélységben úszkálnak, így sznorkelezéssel is láthatjuk őket.
Az Okinawa nyugati részén, Ishigaki szigetén található Sakieda Labirintus komplex zátonyképződményekkel, természetes boltívekkel és alagutakkal rendelkezik, amelyek varázslatos fényhatásokat keltenek. A 3 és 15 méter közötti mélység és a gyengéd áramlatok miatt kezdők számára is alkalmas. A sekély területeken élénk korallzátonyok és változatos halak, például bohóchalak találhatók.
Az Ishigakiban, Kabiraban található Kristálypart (Yamahara Beach) egy eldugott hely, ahol az Omotodake-hegy folyójából származó természetes kristálylerakódások találhatók. Érintetlen vizei korallzátonyoknak, trópusi halaknak és tengeri teknősöknek adnak otthont. A megközelítés egy meredek lejtőn keresztül történik, korlátozott létesítményekkel, ezért a felkészültség és az óvatosság elengedhetetlen.
Japán legnyugatibb szigete. Közelebb van Tajvanhoz, mint Ishigaki szigete. Ishigaki szigetéről repülővel körülbelül 45 perc alatt érhető el. A sziget fénypontja a pörölycápák nagy esélye a pörölycápák megfigyelésére. Közülük ez az a pont, ahol a sziklák, mint épületek, függőlegesen állnak a tengerfenékről 35 méter mélységben.
A víz alatti romokat egy helyi búvár fedezte fel 1986-ban, és a pörölycápákkal együtt népszerű búvárkodási hely Yonaguniban. Körülbelül 15 percre van a kikötőtől. Egy hatalmas, lépcsőzetes alakú fal mintegy 250 m kelet-nyugati és 150 m észak-déli irányban húzódik, így alkotva a romokat.